История Архива РАН  восходит к начальной истории самой Академии наук, учрежденной Указом Петра I от 28 января 1724 г. В соответствии с "Генеральным регламентом" Петра Великого все государственные учреждения обязаны были позаботиться о хранении "бумаг".

Академический архив был основан 6 января (17 января) 1728 г. по указу царя Петра II Алексеевича как хранилище документов Конференции (Общего собрания) и Канцелярии Конференции АН. Распоряжением первого президента Санкт-Петербургской академии наук, лейб-медика Лаврентия Блюментроста, "к архиве" был приставлен студент академической гимназии Г.Ф. Миллер (Мюллер) – будущий ученый, академик и знаток истории Сибири.