Петрозаводская государственная консерватория имени А.К. Глазунова основана в 1967 году как "Петрозаводский филиал Ленинградской ордена Ленина государственной консерватории имени Н.А. Римского-Корсакова". В 1991 году консерватория преобразована в самостоятельный вуз "Петрозаводская государственная консерватория", в 2003 году Петрозаводской государственной консерватории присвоено имя выдающегося русского композитора Александра Константиновича Глазунова, который сыграл значительную роль в развитии музыкального образования России. С 2007 года в консерватории ведется обучение по программам среднего профессионального образования.

В 2010 году при Петрозаводской государственной консерватории имени А.К.Глазунова был открыт Диссертационный Совет. В 2011 году консерватории присвоен статус академии. Приказом Министерства культуры Российской Федерации от 19.08.2014 г. №1634 консерватория была переименована в федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Петрозаводская государственная консерватория имени А.К. Глазунова".