Юрий Сергеевич Кушнерев окончил Калининское Суворовское и Московское Краснознаменское военное училище, а в 1972 году - режиссёрское отделение Высших Курсов Сценаристов и Режиссёров (ВКСР).
С 1968 года Кушнерев работал ассистентом и вторым режиссёром, а позже поступил на службу в киностудию "Мосфильм" в качестве режиссёра.
Он стал вторым режиссёром на съёмках "Мимино", снялся в "Осеннем марафоне", "Паспорте", спродюсировал более 8 фильмов, в том числе, все фильмы Георгия Данелии, срежиссировал фильм "Мой любимый клоун".
Супруга Кушнерева сообщила, что тот давно болел и умер в больнице, а причиной смерти стал оторвавшийся тромб.
Прощание с актёром, режиссёром и продюсером состоится в ритуальном зале ЦКБ 10 января.