Традиции театра марионеток уходят корнями в начало XX века: в 1998 году Правительство Москвы утвердило статус учреждения как Государственного учреждения культуры, подчеркнув важность сохранения и развития упомянутых традиций.

Репертуар театра разработан для детской аудитории. Уникальность проекта в том, что спектакли рассчитаны на детей от двух лет: это небольшой возраст, и другие театры Москвы с ним не работают. Атмосфера семейного театра делает место привлекательным не только для маленьких посетителей, но и для их родителей, дедушек и бабушек.

Пост художественного руководителя театра с момента основания занимает Ирина Ивановна Крячун. Своей основной задачей она всегда видела разностороннее развитие театра: разработку репертуара, участие в международных проектах. Отличительные черты постановок Театра марионеток - это особое режиссёрское видение, музыкальное оформление, авторское решение кукольных образов.

Театр активно гастролирует за рубежом, спектакли вызывают интерес не только у российского зрителя, но и в других странах. Сегодня на сцене идёт 13 постановок.